Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms