Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms