Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam35aQ3UEN2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms