Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gtpbp6Q3U6U5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gtpbp6Q3U6U5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms