Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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