Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ulk3Q3U3Q1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms