Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Otud5Q3U2S4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Otud5Q3U2S4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud5Q3U2S4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Otud5Q3U2S4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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