Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Q3U1D9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Q3U1D9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U1D9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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