Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms