Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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