Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms