Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms