Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136 ms