Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms