Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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