Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms