Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms