Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms