Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms