Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms