Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Col1a2Q01149 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms