Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms