Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms