Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms