Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabpaQ00422 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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