Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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VegfdP97946 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VegfdP97946 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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