Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
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