Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms