Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rps3aP97351 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps3aP97351 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps3aP97351 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps3aP97351 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps3aP97351 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps3aP97351 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps3aP97351 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps3aP97351 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps3aP97351 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms