Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms