Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms