Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Strn4P58404 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms