Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp25P57080 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms