Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms