Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf5P56477 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Irf5P56477 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Irf5P56477 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Irf5P56477 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Irf5P56477 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Irf5P56477 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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