Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp5P56399 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp5P56399 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp5P56399 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp5P56399 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp5P56399 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp5P56399 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp5P56399 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp5P56399 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp5P56399 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp5P56399 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp5P56399 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp5P56399 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp5P56399 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp5P56399 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp5P56399 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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