Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GferP56213 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GferP56213 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms