Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Sh3bp1P55194 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Sh3bp1P55194 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Sh3bp1P55194 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Sh3bp1P55194 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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