Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms