Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CenpcP49452 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CenpcP49452 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CenpcP49452 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CenpcP49452 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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CenpcP49452 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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CenpcP49452 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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CenpcP49452 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CenpcP49452 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms