Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms