Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LtbP41155 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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LtbP41155 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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LtbP41155 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LtbP41155 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms