Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms