Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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