Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms