Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RxraP28700 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RxraP28700 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RxraP28700 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RxraP28700 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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