Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atxn10P28658 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atxn10P28658 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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