Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms