Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PdgfraP26618 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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