Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NdnP25233 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NdnP25233 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms